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平台提供的运行时内核说明
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打开JupyterLab界面后可以看到平台提供的运行时内核 :numref:`kernel_iga` 。


.. figure:: kernal_iga_xdc.png
   :name: kernel_iga

   平台提供的运行内核

目前平台提供如下三种内核供运行使用。后期会根据需求增加公用内核，及内核中的默认类库。

#. Python 3.11 [系统]
#. Python 3.12 [Conda]
#. R 4.4 [Conda]

.. note::
   1. 目前对Python生物信息相关技术了解较少，需要安装相关类库欢迎联系信息中心。
   #. 如果对运行内核有特殊需求，可联系信息中心针对用户进行定制。

内核说明：Python 3.11 [系统]
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使用的Python为服务器操作系统自带的 Python 3.11 。
相关模块由 Debian 开发团队打包，运行稳定，但版本相对较旧；
一般而言软件包进入 Debian 仓储库意味着相对成熟并会有较好的开发支持。
如果对运行的版本没有特殊需求，推荐使用此内核。
安装的模块包括：

通用科学计算模块：

- python3-pandas
- python3-numpy
- python3-scipy

地理信息常用模块：

- python3-gdal
- python3-pyproj
- python3-shapely
- python3-fiona
- python3-mapnik
- python3-geopandas
- python3-mapscript
- python3-cairosvg
- python3-cartopy
- python3-folium
- python3-fiona
- python3-rasterio

生物信息模块：

- python3-skbio
- python3-biotools
- python3-biopython

内核说明：Python 3.12 [Conda]
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基于Conda环境安装的地理信息内核，
Python版本为 3.12。

安装的地理信息模块包括：

- gdal
- geopandas
- shapely
- folium

安装的生物信息模块包括：

- neurokit2

内核说明：R 4.4 [Conda]
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基于Conda环境安装的R语言内核， 版本为 R 4.4.1 。
安装的模块包括：

- r-devtools
- r-ggplot2
- r-reshape2
- r-corrplot